<strike id="zd1rt"></strike>
<span id="zd1rt"><dl id="zd1rt"></dl></span>
<strike id="zd1rt"><dl id="zd1rt"><del id="zd1rt"></del></dl></strike><strike id="zd1rt"><dl id="zd1rt"><ruby id="zd1rt"></ruby></dl></strike><progress id="zd1rt"><noframes id="zd1rt"><ruby id="zd1rt"><video id="zd1rt"><del id="zd1rt"></del></video></ruby>
<strike id="zd1rt"></strike><span id="zd1rt"></span><span id="zd1rt"></span>
<strike id="zd1rt"><video id="zd1rt"><ruby id="zd1rt"></ruby></video></strike><strike id="zd1rt"></strike><strike id="zd1rt"></strike>
<strike id="zd1rt"></strike><th id="zd1rt"><dl id="zd1rt"><ruby id="zd1rt"></ruby></dl></th>
<strike id="zd1rt"></strike><strike id="zd1rt"></strike>
<strike id="zd1rt"><i id="zd1rt"><del id="zd1rt"></del></i></strike><strike id="zd1rt"><video id="zd1rt"><strike id="zd1rt"></strike></video></strike>
農業知識 Wudalianchi city kanasugi seed industry co., LTD
大豆首次實現圖形結構基因組構建,中國科學家的新突破!
2020-07-25

大豆基因組研究首次實現基于圖形結構基因組構建


2020年6月17日23時,國際權威學術期刊《細胞》在線發表了中國科學院遺傳與發育生物學研究所田志喜等科研團隊關于大豆泛基因組的最新研究進展。該項成果突破傳統線性基因組的存儲形式,在植物中首次實現了基于圖形結構基因組 (graph-based genome) 的構建,將引領全新的下一代基因組學研究思路和方法,被審稿人稱為“基因組學的里程碑工作”,是中國科學院種子創新研究院建立后取得的又一重大研究突破。


大豆是重要的糧食經濟作物。我國大豆需求量大,且消費對外依賴嚴重。因此,加強研究、提高大豆生產能力迫在眉睫。高質量參考基因組是作物育種基礎研究和應用研究的前提基礎。傳統的基因組學研究是將不同堿基以線性的形式存儲于染色體上,且多基于一個參考基因組來獲取一個物種的基因信息。由于一個物種中不同個體間存在遺傳變異,線性基因組不能同時體現不同個體的遺傳變異情況,這極大地限制了不同個體遺傳變異的鑒定和分析。構建囊括一個物種所有遺傳信息的新型存儲形式——“泛基因組”已成為當前基因組學研究的重要任務和前沿挑戰。


此前,田志喜研究團隊在對大豆種質資源的深度重測序和群體遺傳學分析中發現,不同大豆種質資源之間存在較大的遺傳變異,單一或少數基因組不能代表大豆群體的所有遺傳變異。大豆基礎研究和分子設計育種亟需能夠代表不同大豆種質材料的全新基因組資源。


為此,田志喜研究團隊聯合中科院遺傳發育所梁承志和朱保葛研究團隊、中科院分子植物科學卓越創新中心韓斌院士團隊、上海師范大學黃學輝教授團隊以及北京貝瑞和康生物技術有限公司相關人員,對來自世界大豆主產國的2898個大豆種質材料進行了深度重測序和群體結構分析,精心挑選出26個最具代表性的大豆種質材料,包括3個野生大豆,9個農家種和14個現代栽培品種。研究團隊利用最新組裝策略,對26個大豆種質材料進行了高質量的基因組從頭組裝和精確注釋,contig N50平均長度達22.6 Mb, scaffold N50 平均長度達 51.2 Mb。在此基礎上,結合已經發表的中黃13、Williams 82 和 W05 基因組,開展了系統的基因組比較,構建了高質量的基于圖形結構泛基因組,挖掘到大量利用傳統基因組不能鑒定到的大片段結構變異。


經深入分析發現,結構變異在重要農藝性狀調控中發揮重要作用:例如,HPS基因的結構變異調控大豆種皮亮度變化;野生與栽培大豆CHS基因簇的結構變異是導致種皮顏色由黑色向黃色馴化的主要原因;SoyZH13_14G179600基因結構變異導致了其在不同種質材料中基因表達的差異,可能與調控大豆缺鐵失綠癥有關。此外,研究還鑒定到15個結構變異導致了不同基因間的融合,這為新基因的產生研究提供了重要線索。此高質量圖形結構泛基因組的構建不僅本身具有重要的理論意義和應用價值,同時為過去已經開展的大量重測序數據提供了一個全新的分析平臺,將使得這些數據獲得“第二次生命”。


本次泛基因組研究所選用的大豆種質材料不僅在遺傳多樣性上具有代表性,且具有重要的育種和生產價值。其中滿倉金、十勝長葉、紫花4號等種質材料作為骨干核心親本已各自培育出了上百個優良新品種;黑河43、齊黃34、豫豆22、皖豆28、晉豆23、徐豆1號等品種都是各個大豆主產區推廣面積最大的主栽品種。該基因組和相關的2898份種質材料遺傳變異的發布為大豆研究提供了極為重要的資源和平臺,將大力推進大豆分子設計育種,助力實現大豆“綠色革命”。


來源:中國農網


微信二維碼

快捷鏈接 kuaijielianjie
新聞中心 xinwenzhongxin
技術指導 jishuizhidao
欧美大屁股xxxx高跟欧美黑人,中文字幕精品无码亚洲字幕成a人,18禁止进入1000部拍拍拍,性别 隐 偷窥 tube
龙游县果仁有限公司 郓城县科技有限公司 沂水县果仁有限公司 微山县餐饮有限公司 沂南县培训有限公司 平凉市干果有限公司
崇州市餐饮有限公司 景宁畲族自治县餐饮有限公司 苍南县坚果有限公司 商洛市竹木有限公司 德清县水果有限公司 六盘水市水果有限公司
仙居县干果有限公司 武义县花木有限公司 铜川市竹木有限公司 高唐县培训有限公司 新昌县藤苇有限公司 毕节市餐饮有限公司